ISSN 1694-6286
e-ISSN 1694-9250
Макала жөнөтүү
Кыргыз
Кыргыз улуттук агрардык университетинин жарчысы

Макаланы издөө

Ири мүйүздүү малдын инфекциялык ринотрахеитин аныктоо үчүн ПЧР коюунун параметрлерин оптималдаштыруу

С Самат Жаксылык К Куляйсан Султанкулова А Аида Боронбаева Г Гаухар Шыныбекова Н Нурлан Кожабергенов
Кабыл алынган убакыт 14.10.2025
Түзөтүлгөн 09.02.2026
Жарыяланган 10.03.2026

Аннотация

Бул иликтөөнүн актуалдуулугу малдын узакка созулган вирустук инфекцияларын лабораториялык диагностиканы жогорулатуу зарылдыгында турат, анткени бул инфекциялардын учурунда оору жараткан агенттин концентрациясы аз болуп, аны салттуу ыкмалар менен аныктоо кыйынчылык жаратат. Изилдөөнүн максаты – ири мүйүздүү малдын инфекциялык ринотрахеити вирусун так идентификациялоо үчүн gB генинин анализине негизделген полимеразалык чынжыр реакциясын (ПЧР) оптималдаштыруу. Ишти аткарууда молекулярдык биологиянын заманбап ыкмалары, гендик инженерия жана биоинформатика колдонулду, анын ичинде нуклеотиддик секвенциялардын жыйноосу, иштетилиши жана салыштырылышы. Изилдөө учурунда ири мүйүздүү малдын инфекциялык ринотрахеити вирусунун gB генинин нуклеотиддик секвенциялары жыйналып, анализденди, натыйжада анын консервативдик, вариабелдүү жана полиморфтук аймактары аныкталды. Анализдин негизинде жогорку спецификалык таасири бар праймерлерди синтездөө жана иштеп чыгуу жүргүзүлүп, вирус геномунун максаттуу фрагментин амплификациялоого мүмкүндүк берилди. Иш учурунда ири мүйүздүү малдын инфекциялык ринотрахеити вирусунун ДНКсын бөлүп алуу жүргүзүлүп, амплификация шарттарын оптималдаштыруу үчүн негиз түзүлдү. Ошондой эле полимеразалык чынжыр реакциясынын температуралык параметрлери жана реагенттердин сандык курамы оптималдаштырылып, методдун жогорку сезгичтиги жана специфичтиги камсыздалды. Изилдөө натыйжалары праймерлерди жана реакция параметрлерин рационалдуу тандоо аркылуу диагностиканын эффективдүүлүгүн жогорулатууга мүмкүнчүлүк берерин көрсөттү. Практикалык мааниси – алынган маалыматтар жана иштелип чыккан методикалык ыкмалар ветеринардык диагностикалык лабораториялар жана илимий-изилдөө мекемелер тарабынан ири мүйүздүү малдын инфекциялык ринотрахеити вирусунун ПЦР-диагностикасын өркүндөтүү үчүн колдонулушу мүмкүн

Негизги сөздөр

праймерлер; BoHV-1; ПЧР-диагностика; gB гени; реакцияны оптималдаштыруу
Цитаталоо
Zhaksylyk, S., Sultankulova, K., Boronbaeva, A., Shynybekova, G., & Kozhabergenov, N. (2026). Optimisation of PCR conditions for the detection of infectious bovine rhinotracheitis. Bulletin of the Kyrgyz National Agrarian University, 24(1), 10-17. https://doi.org/10.63621/bknau./1.2026.10

Колдонулган булактар

  1. Abukhadra, B.A., Mosad, S.M., & El-Rahman, S.A. (2022). Molecular identification of bovine alpha herpesvirus subtype 1.1 in field isolates in Egypt by phylogenetic analysis of glycoprotein B gene. Advances in Animal and Veterinary Sciences, 10(8), 1739-1746. doi: 10.17582/journal.aavs/2022/10.8.1739.1746.
  2. Aslim, H.P., & Bulut, O. (2024). Detection of BoHV-1 – comparative evaluation of real time PCR, real time LAMP and subtyping. Acta Scientiae Veterinariae, 52(1), article number 1954. doi: 10.22456/1679-9216.139938.
  3. Barrett, D., Lane, E., Lozano, J.M., O’Keeffe, K., & Byrne, A.W. (2024). Bovine herpes virus type 1 (BoHV-1) seroprevalence, risk factor and bovine viral diarrhoea (BVD) co-infection analysis from Ireland. Scientific Reports, 14(1), article number 867. doi: 10.1038/s41598-023-50433-5.
  4. BLAST. (n.d.). Retrieved from https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.
  5. Brock, J., Guelbenzu-Gonzalo, M., Lozano, J.M., Lane, E.A., Gunn, M., Brady, S., Thulke, H.H., & Graham, D.A. (2025). Prevalence and risk factors for bovine herpesvirus type 1 (BoHV-1) infection in Irish beef herds: Results from the National Beef Welfare Scheme 2023. Irish Veterinary Journal, 78, article number 22. doi: 10.1186/s13620-025-00308-0.
  6. Dias, J.A., Alfieri, A.A., Ferreira-Neto, J.S., Gonçalves, V.S., & Muller, E.E. (2013). Seroprevalence and risk factors of bovine herpesvirus 1 infection in cattle herds in the state of Paraná, Brazil. Transboundary and Emerging Diseases, 60(1), 39-47. doi: 10.1111/j.1865-1682.2012.01316.x.
  7. GenBank. (n.d.). Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/.
  8. González, C.B., Briñez, K., Tobón, J.C., Sanjuanelo Corredor, D.W., Bauermann, F.V., & Guzmán Barragán, B.L. (2025). Cross-sectional seroprevalence study of bovine herpesvirus 1, bovine respiratory syncytial virus, and parainfluenza virus 3 in cattle from Villavicencio, Colombia. BMC Veterinary Research, 21, article number 24. doi: 10.1186/s12917-024-04461-6.
  9. Horwood, P.F., & Mahony, T.J. (2011). Multiplex real-time RT-PCR detection of three viruses associated with the bovine respiratory disease complex. Journal of Virological Methods, 171(2), 360-363. doi: 10.1016/j.jviromet.2010.11.020.
  10. Iscaro, C., Cambiotti, V., Petrini, S., & Feliziani, F. (2021). Control programs for infectious bovine rhinotracheitis (IBR) in European countries: An overview. Animal Health Research Reviews, 22(2), 136-146. doi: 10.1017/S1466252321000116.
  11. Jiang, L., Zhang, G., Wang, P., Niu, X., Liu, Q., Zhang, S., Gao, W., & Li, Y. (2024). Simultaneous detection of bovine viral diarrhea virus (BVDV) and bovine herpesvirus 1 (BoHV-1) using recombinase polymerase amplification. Scientific Reports, 14, article number 10169. doi: 10.1038/s41598-024-56869-7.
  12. Karabasova, A., Turkeev, M.K., Tulepov, B.S., Lesov, B.E., Akshalova, P.B., Tujmebaeva, K.Zh., Akylbaj, A.K., Kanatbaev, S.G., & Kajmoldina, S.E. (2025). Analysis of serological and molecular genetic methods for the diagnosis of infectious rhinotracheitis in cattle in Kazakhstan. Science and Education, 1(78), 172-186. doi: 10.52578/2305-9397-2025-1-1-172-186.
  13. Lumiprobe. (n.d.). DNA amplification with ProbeMaster® UNI PCR/qPCR reaction mixture, 5x. Retrieved from https://ru.lumiprobe.com/protocols/pcr-qpcr-master-mix-5x?utm_source.
  14. Mandelik, R., Bires, J., Ozsvari, L., Hodnik, J.J., & Vilcek, S. (2021). Infectious bovine rhinotracheitis control program in Slovakia. Frontiers in Veterinary Science, 8, article number 675521. doi: 10.3389/fvets.2021.675521.
  15. Muylkens, B., Thiry, J., KIBRen, P., Schynts, F., & Thiry, E. (2007). Bovine herpesvirus 1 infection and infectious bovine rhinotracheitis. Veterinary Research, 38(2), 181-209. doi: 10.1051/vetres:2006059.
  16. Ostler, J.B., & Jones, C. (2023). The bovine herpesvirus 1 latency-reactivation cycle, a chronic problem in the cattle industry. Viruses, 15(2), article number 552. doi: 10.3390/v15020552.
  17. Pawar, S.S., Meshram, C.D., Singh, N.K., Sonwane, A.A., Saini, M., Rautmare, S.S., Muglikar, D.M., Mishra, B.P., & Gupta, P.K. (2014). Rapid detection of bovine herpesvirus 1 in bovine semen by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay. Archives of Virology, 159(4), 641-648. doi: 10.1007/s00705-013-1869-2.
  18. Raaperi, K., Nurmoja, I., Orro, T., & Viltrop, A. (2010). Seroepidemiology of bovine herpesvirus 1 (BHV1) infection among Estonian dairy herds and risk factors for the spread within herds. Preventive Veterinary Medicine, 96(1-2), 74-81. doi: 10.1016/j.prevetmed.2010.06.001.
  19. Wu, Y., Zhang, W., Yi, C., He, K., Hu, C., Ye, G., & Zhang, A. (2025). Rapid, sensitive, and visible RPA-LFD assay for BoHV-1 and BoHV-5. Microbiology Spectrum, 4, 13(3), article number e0089524. doi: 10.1128/spectrum.00895-24.
  20. Xu, L., et al. (2024). Establishment of a real-time fluorescent quantitative PCR detection method and phylogenetic analysis of BoAHV-1. BMC Veterinary Research, 20, article number 180. doi: 10.1186/s12917-024-04025-8.
  21. Yu, Z., Zhao, Z., Chen, L., Yan, H., Cui, Q., Ju, X., Yong, Y., Liu, X., Ma, X., & Zhang, G. (2022). Development of a droplet digital PCR assay to detect bovine alphaherpesvirus 1 in bovine semen. BMC Veterinary Research, 18, article number 125. doi: 10.1186/s12917-022-03235-2.
  22. Zhang, J., Cao, J., Cao, L., Zhang, C., Gong, L., Kang, X., Li, D., & Zhang, Y. (2025). Research progress on the diagnostic techniques and vaccine development of bovine herpesvirus types 1. Frontiers in Veterinary Science, 12, article number 1703336. doi: 10.3389/fvets.2025.1703336.