KG0 – FAO AGRIS data provider 2026
ISSN 1694-6286
e-ISSN 1694-9250
Отправить статью
Русский
Вестник Кыргызcкого национального аграрного университета

Поиск статьи

Оптимизация параметров постановки ПЦР для выявления инфекционного ринотрахеита крупного рогатого скота

С Самат Жаксылык К Куляйсан Султанкулова А Аида Боронбаева Г Гаухар Шыныбекова Н Нурлан Кожабергенов
Получено 14.10.2025
Доработано 09.02.2026
Опубликовано 10.03.2026

Аннотация

Актуальность данной работы определяется необходимостью повышения эффективности лабораторной диагностики персистирующих вирусных инфекций крупного рогатого скота, для которых характерны низкие концентрации возбудителя и затрудненность его выявления традиционными методами. Цель исследования заключалась в разработке и оптимизации полимеразной цепной реакции (ПЦР) для точной идентификации вируса инфекционного ринотрахеита крупного рогатого скота на основе анализа гена gB. Для выполнения работы использованы современные методы молекулярной биологии, генной инженерии и биоинформатического анализа, включая сбор, обработку и выравнивание нуклеотидных последовательностей. В ходе исследования были собраны и проанализированы нуклеотидные последовательности гена gB вируса инфекционного ринотрахеита крупного рогатого скота, что позволило выявить его консервативные, вариабельные и полиморфные участки. На основании результатов анализа была разработана и синтезирована высокоспецифичная пара праймеров, обеспечивающая селективное амплифицирование целевого фрагмента генома вируса. В ходе работы было проведено выделение ДНК вируса инфекционного ринотрахеита крупного рогатого скота, необходимое для оптимизации условий амплификации. Также установлены оптимальные температурные параметры полимеразной цепной реакции и подобран количественный состав реагентов, обеспечивающие высокую чувствительность и специфичность метода. Результаты исследования подтвердили возможность повышения эффективности диагностики путем рационального подбора праймеров и параметров реакции. Практическая ценность работы заключается в том, что полученные данные и разработанные методические подходы могут быть использованы ветеринарными диагностическими лабораториями и научно-исследовательскими учреждениями для совершенствования ПЦР-диагностики вируса инфекционного ринотрахеита крупного рогатого скота

Ключевые слова

праймеры; BoHV-1; ПЦР-диагностика; gB ген; оптимизация реакции
ЦИТИРОВАНИЕ
Zhaksylyk, S., Sultankulova, K., Boronbaeva, A., Shynybekova, G., & Kozhabergenov, N. (2026). Optimisation of PCR conditions for the detection of infectious bovine rhinotracheitis. Bulletin of the Kyrgyz National Agrarian University, 24(1), 10-17. https://doi.org/10.63621/bknau./1.2026.10

Использованные источники

  1. Abukhadra, B.A., Mosad, S.M., & El-Rahman, S.A. (2022). Molecular identification of bovine alpha herpesvirus subtype 1.1 in field isolates in Egypt by phylogenetic analysis of glycoprotein B gene. Advances in Animal and Veterinary Sciences, 10(8), 1739-1746. doi: 10.17582/journal.aavs/2022/10.8.1739.1746.
  2. Aslim, H.P., & Bulut, O. (2024). Detection of BoHV-1 – comparative evaluation of real time PCR, real time LAMP and subtyping. Acta Scientiae Veterinariae, 52(1), article number 1954. doi: 10.22456/1679-9216.139938.
  3. Barrett, D., Lane, E., Lozano, J.M., O’Keeffe, K., & Byrne, A.W. (2024). Bovine herpes virus type 1 (BoHV-1) seroprevalence, risk factor and bovine viral diarrhoea (BVD) co-infection analysis from Ireland. Scientific Reports, 14(1), article number 867. doi: 10.1038/s41598-023-50433-5.
  4. BLAST. (n.d.). Retrieved from https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.
  5. Brock, J., Guelbenzu-Gonzalo, M., Lozano, J.M., Lane, E.A., Gunn, M., Brady, S., Thulke, H.H., & Graham, D.A. (2025). Prevalence and risk factors for bovine herpesvirus type 1 (BoHV-1) infection in Irish beef herds: Results from the National Beef Welfare Scheme 2023. Irish Veterinary Journal, 78, article number 22. doi: 10.1186/s13620-025-00308-0.
  6. Dias, J.A., Alfieri, A.A., Ferreira-Neto, J.S., Gonçalves, V.S., & Muller, E.E. (2013). Seroprevalence and risk factors of bovine herpesvirus 1 infection in cattle herds in the state of Paraná, Brazil. Transboundary and Emerging Diseases, 60(1), 39-47. doi: 10.1111/j.1865-1682.2012.01316.x.
  7. GenBank. (n.d.). Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/.
  8. González, C.B., Briñez, K., Tobón, J.C., Sanjuanelo Corredor, D.W., Bauermann, F.V., & Guzmán Barragán, B.L. (2025). Cross-sectional seroprevalence study of bovine herpesvirus 1, bovine respiratory syncytial virus, and parainfluenza virus 3 in cattle from Villavicencio, Colombia. BMC Veterinary Research, 21, article number 24. doi: 10.1186/s12917-024-04461-6.
  9. Horwood, P.F., & Mahony, T.J. (2011). Multiplex real-time RT-PCR detection of three viruses associated with the bovine respiratory disease complex. Journal of Virological Methods, 171(2), 360-363. doi: 10.1016/j.jviromet.2010.11.020.
  10. Iscaro, C., Cambiotti, V., Petrini, S., & Feliziani, F. (2021). Control programs for infectious bovine rhinotracheitis (IBR) in European countries: An overview. Animal Health Research Reviews, 22(2), 136-146. doi: 10.1017/S1466252321000116.
  11. Jiang, L., Zhang, G., Wang, P., Niu, X., Liu, Q., Zhang, S., Gao, W., & Li, Y. (2024). Simultaneous detection of bovine viral diarrhea virus (BVDV) and bovine herpesvirus 1 (BoHV-1) using recombinase polymerase amplification. Scientific Reports, 14, article number 10169. doi: 10.1038/s41598-024-56869-7.
  12. Karabasova, A., Turkeev, M.K., Tulepov, B.S., Lesov, B.E., Akshalova, P.B., Tujmebaeva, K.Zh., Akylbaj, A.K., Kanatbaev, S.G., & Kajmoldina, S.E. (2025). Analysis of serological and molecular genetic methods for the diagnosis of infectious rhinotracheitis in cattle in Kazakhstan. Science and Education, 1(78), 172-186. doi: 10.52578/2305-9397-2025-1-1-172-186.
  13. Lumiprobe. (n.d.). DNA amplification with ProbeMaster® UNI PCR/qPCR reaction mixture, 5x. Retrieved from https://ru.lumiprobe.com/protocols/pcr-qpcr-master-mix-5x?utm_source.
  14. Mandelik, R., Bires, J., Ozsvari, L., Hodnik, J.J., & Vilcek, S. (2021). Infectious bovine rhinotracheitis control program in Slovakia. Frontiers in Veterinary Science, 8, article number 675521. doi: 10.3389/fvets.2021.675521.
  15. Muylkens, B., Thiry, J., KIBRen, P., Schynts, F., & Thiry, E. (2007). Bovine herpesvirus 1 infection and infectious bovine rhinotracheitis. Veterinary Research, 38(2), 181-209. doi: 10.1051/vetres:2006059.
  16. Ostler, J.B., & Jones, C. (2023). The bovine herpesvirus 1 latency-reactivation cycle, a chronic problem in the cattle industry. Viruses, 15(2), article number 552. doi: 10.3390/v15020552.
  17. Pawar, S.S., Meshram, C.D., Singh, N.K., Sonwane, A.A., Saini, M., Rautmare, S.S., Muglikar, D.M., Mishra, B.P., & Gupta, P.K. (2014). Rapid detection of bovine herpesvirus 1 in bovine semen by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay. Archives of Virology, 159(4), 641-648. doi: 10.1007/s00705-013-1869-2.
  18. Raaperi, K., Nurmoja, I., Orro, T., & Viltrop, A. (2010). Seroepidemiology of bovine herpesvirus 1 (BHV1) infection among Estonian dairy herds and risk factors for the spread within herds. Preventive Veterinary Medicine, 96(1-2), 74-81. doi: 10.1016/j.prevetmed.2010.06.001.
  19. Wu, Y., Zhang, W., Yi, C., He, K., Hu, C., Ye, G., & Zhang, A. (2025). Rapid, sensitive, and visible RPA-LFD assay for BoHV-1 and BoHV-5. Microbiology Spectrum, 4, 13(3), article number e0089524. doi: 10.1128/spectrum.00895-24.
  20. Xu, L., et al. (2024). Establishment of a real-time fluorescent quantitative PCR detection method and phylogenetic analysis of BoAHV-1. BMC Veterinary Research, 20, article number 180. doi: 10.1186/s12917-024-04025-8.
  21. Yu, Z., Zhao, Z., Chen, L., Yan, H., Cui, Q., Ju, X., Yong, Y., Liu, X., Ma, X., & Zhang, G. (2022). Development of a droplet digital PCR assay to detect bovine alphaherpesvirus 1 in bovine semen. BMC Veterinary Research, 18, article number 125. doi: 10.1186/s12917-022-03235-2.
  22. Zhang, J., Cao, J., Cao, L., Zhang, C., Gong, L., Kang, X., Li, D., & Zhang, Y. (2025). Research progress on the diagnostic techniques and vaccine development of bovine herpesvirus types 1. Frontiers in Veterinary Science, 12, article number 1703336. doi: 10.3389/fvets.2025.1703336.